连花清瘟是以岭药业2003年“非典”期间研发的中药新药，中国军事医学科学院开展了连花清瘟抗冠状病毒SARS的研究，结果表明，连花清瘟胶囊抑制SARS－CoV病毒的半数有效浓度（IC50）为0.09mg/毫升，其治疗指数为40.33，可明显抑制SARS病毒的复制。连花清瘟也是为数不多有证据表明具有抗SARS－CoV作用的中药之一。因此在连花清瘟颗粒的说明书中明确了这一作用。2015年另一种新型冠状病毒引发了中东呼吸综合征，国家卫健委在诊疗方案中推荐连花清瘟胶囊/颗粒作为防治用药。

近年来中国中医科学院、广州医科大学呼吸疾病国家重点实验室等权威科研院所对该药进行的大量科学研究表明，连花清瘟胶囊具有广谱抗病毒作用，对甲型流感病毒、乙型流感病毒、禽流感病毒（、腺病毒以及多种普通感冒病毒都有很好的抑制拮抗作用，同时可有效抑制多种细菌。

中药与西药作用机理不同，中药并不是针对某种单一病毒，而是对多种病毒感染引起的如发烧、咳嗽、咳痰等症候群发挥作用。新型冠状病毒性肺炎如果有相应的症状，连花清瘟可适用。对于接触新型冠状病毒的医护人员，可使用连花清瘟进行预防。

凭借着广谱抗病毒、抑制细菌、退热消炎等治疗特色，连花清瘟胶囊十多年来在非典、中东呼吸综合征、甲型流感、乙型流感、禽流感、手足口病等一系列传染性公共卫生事件中屡屡发挥重要作用。日前，国家卫健委发布的《流行性感冒诊疗方案（2019年版）》对近期流感的诊断和治疗给出了权威建议，连花清瘟胶囊（颗粒）等成为推荐的有效中药之一。本次入选新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第四版），系连花清瘟2005年以来获得国家层面第19次推荐。