省疾病预防控制中心在抗击非典、手足口病、H1N1流感、人感染H7N9禽流感及预防控制艾滋病等重大传染病，以及救灾防病和抗震救灾重大事件中屡建奇功，先后荣膺中组部、人社部、卫生部、全国总工会授予的“抗震救灾英雄集体”，“河南省文明单位”、“河南省五一劳动奖章”、“全国卫生系统先进集体”、“全国精神文明建设工作先进单位”、“全国文明单位”、“人感染H7N9禽流感疫情防控工作先进单位”等一系列荣誉称号，彰显了党和政府的肯定及褒奖。
省疾病预防控制中心拥有新发传染病、艾滋病、食品安全三个省医学重点学科，承担着一批重大科技攻关项目。拥有全省独有的BSL-3实验室、26个BSL-2实验室、省A级SPF实验动物室和生物资源库。拥有高效液相色谱仪、液相色谱质谱联用仪等一大批先进的检验检测仪器设备，总价值达1.1亿元。卫生检测检验中心获得国家实验室认可证书和计量认证合格证书，认可项目达到788项，并被商务部第一批授予“全国食品安全检测机构”称号。艾滋病确认、脊灰监测、麻疹监测等实验室均通过WHO或卫生部认证;与WHO、联合国儿童基金会、美国CDC等20多个国际组织、国外机构和学术团体建立了合作关系。
近年来，省疾控中心不断强化人才建设，加强中心领军人才、科技创新人才的培养和支持。目前，拥有硕士89人，博士15人。其中享受国务院特贴专家2人，省级领军人才3人，创新人才等技术带头人9人。在全国性专业学术团体任职的有20余人，担任郑州大学、河南大学硕士生导师7人。传染病、艾滋病与结核病2个科研团队获批省科技创新型团队。先后获得河南省博士后研发基地、国家自然科学基金依托单位、河南省生物疫苗与诊断试剂产业技术创新战略联盟、国家疫苗临床研究基地。近年来，取得厅级、省级、国家级科研成果奖30多项;获省部级、厅级科研项目60项;自主立项研究课题超百项，年发表学术论文超过180篇。
省疾控中心始终坚持以服务人民群众健康为根本，在省委、省政府和省卫生厅的领导下，围绕创建省级一流疾病预防控制中心和巩固全国文明单位创建成果的目标，以艾滋病、结核病、疟疾、疫苗可预防传染病、重点肠道传染病和媒介传染病，以及H1N1流感、手足口病新发传染病为工作重点，全面开展传染病监测与防控，取得了显著成绩。全面落实消除疟疾行动计划、消除麻疹行动计划，强化消灭碘缺乏病、克山病与大骨节病等防治措施。采取有效措施推进改水、改厕工作，切实加强以食品安全为重点的健康危害因素监测和控制，加快全省慢性病防控网络建设，大力开展健康教育与健康促进，为促进全省城乡居民健康做出突出成绩，全省传染病得到有效控制。
省疾控中心坚持领导班子表率作用，坚定贯彻党的理论和路线方针政策，全面贯彻践行“三个代表”和科学发展观重要思想，扎实开展群众路线教育实践活动，牢固树立全心全意为人民服务的宗旨意识，省疾控中心向全省人民公开承诺、践诺九大社会服务职能：向社会承诺，让人民满意！以追求卓越的标准，全力构建政府认可、百姓满意的疾病预防控制事业。
2008年开始实施扩大国家免疫规划以来，我省常规免疫接种率始终保持在95%以上，报告接种及时率、完整率均在90%以上。5岁以下儿童乙肝表面抗原携带率保持在1%以下，达到全国先进水平;全省连续保持无脊灰状态，麻疹发病控制到历史的最低水平。2013年，全省预防接种预警机制和“疫苗通”系统的短信提醒功能使得全省适龄儿童建证率和免疫规划疫苗的接种率进一步提高。艾滋病防治实现了“两降一提”目标;结核病防治纳入省政府目标管理，现代结核病控制策略覆盖率持续保持100%;寄生虫病、重大地方病得到有效控制，消除疟疾目标基本实现;在世界上检出B群F4c志贺菌Xv变种，首次发现了沙门菌新的耐药基因;确定了新布尼亚病毒为“蜱虫病”的主要元凶，标志着省疾控中心在新发传染病的发现与研究上达到了国际先进水平;食品安全风险监测工作、学校常见病防治在全国处于领先地位;以高血压、糖尿病、肿瘤、精神卫生等慢性非传染病疾病防治项目得到国家肯定，健康教育成效显著;卫生检测检验对外服务出具的检测数据和结果在全球60个国家和地区得到互认……
在2008年抗震救灾期间，省疾控中心组成“防疫突击队”成为共和国历史上第一批赴川、并在前线坚持时间最长的防疫队，也是第一支空降汶川禹理“孤岛”山区执行艰巨任务的防疫突击队，在共和国特大地震的救灾防病工作中经受到了严峻的考验、建树奇功。在2010年信阳的蜱虫媒介传播发热伴血小板减少综合症疫情，2011年信阳潢川大面积不明原因腹泻、永城-涡阳(安徽)发现丙肝聚集性病例等突发公共卫生事件处置的“战斗”中，显示了省疾控中心的应急处置能力，得到了上级领导部门的认可和肯定。2013年的人感染H7N9禽流感疫情防控中，省疾控中心应急队员日夜值班，轮流坚守岗位，成功处置了4起确诊病例，得了卫计委、省卫生厅的通报表扬，被卫计委授予“人感染H7N9禽流感疫情防控工作先进单位”。
省疾控中心将继续以邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观为指导，深入贯彻落实党的十八大和十八届二中、三中全会精神，深入学习贯彻习近平总书记系列重要讲话精神实质和核心要义作为重大政治任务，继续按照党的群众路线教育实践活动指导思想和目标要求和省委“一学三促四抓”常抓不懈，按照《中共中央关于全面深化改革若干重大问题的决定》提出的深化医药卫生体制改革要求，结合《中共中央、国务院关于深化卫生体制改革的意见》等主要目标任务，加快推进全省疾病预防控制服务均等化进程，在完善公共卫生服务体系、保障和改善民生方面做出行业的积极贡献，为全面建成小康社会，进而建成富强民主文明和谐的社会主义现代化国家、实现中华民族伟大复兴的中国梦，推进中原经济区建设，实现中原崛起、河南振兴做出新的贡献。